Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFHD2Q96C19 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFHD2Q96C19 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EFHD2Q96C19 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EFHD2Q96C19 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFHD2Q96C19 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EFHD2Q96C19 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EFHD2Q96C19 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EFHD2Q96C19 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EFHD2Q96C19 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EFHD2Q96C19 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EFHD2Q96C19 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EFHD2Q96C19 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EFHD2Q96C19 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EFHD2Q96C19 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EFHD2Q96C19 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFHD2Q96C19 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFHD2Q96C19 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFHD2Q96C19 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFHD2Q96C19 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFHD2Q96C19 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EFHD2Q96C19 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EFHD2Q96C19 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EFHD2Q96C19 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFHD2Q96C19 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EFHD2Q96C19 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFHD2Q96C19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EFHD2Q96C19 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EFHD2Q96C19 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFHD2Q96C19 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EFHD2Q96C19 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EFHD2Q96C19 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFHD2Q96C19 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EFHD2Q96C19 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EFHD2Q96C19 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EFHD2Q96C19 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFHD2Q96C19 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EFHD2Q96C19 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFHD2Q96C19 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EFHD2Q96C19 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFHD2Q96C19 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EFHD2Q96C19 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFHD2Q96C19 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFHD2Q96C19 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFHD2Q96C19 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFHD2Q96C19 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFHD2Q96C19 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFHD2Q96C19 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFHD2Q96C19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EFHD2Q96C19 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFHD2Q96C19 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFHD2Q96C19 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EFHD2Q96C19 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFHD2Q96C19 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFHD2Q96C19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFHD2Q96C19 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFHD2Q96C19 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFHD2Q96C19 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFHD2Q96C19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EFHD2Q96C19 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EFHD2Q96C19 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFHD2Q96C19 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFHD2Q96C19 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFHD2Q96C19 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFHD2Q96C19 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFHD2Q96C19 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EFHD2Q96C19 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFHD2Q96C19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFHD2Q96C19 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFHD2Q96C19 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFHD2Q96C19 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFHD2Q96C19 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFHD2Q96C19 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFHD2Q96C19 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFHD2Q96C19 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFHD2Q96C19 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EFHD2Q96C19 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFHD2Q96C19 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EFHD2Q96C19 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms