Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATG2BQ96BY7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG2BQ96BY7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG2BQ96BY7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG2BQ96BY7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATG2BQ96BY7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATG2BQ96BY7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG2BQ96BY7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG2BQ96BY7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG2BQ96BY7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATG2BQ96BY7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ATG2BQ96BY7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ATG2BQ96BY7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
ATG2BQ96BY7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ATG2BQ96BY7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG2BQ96BY7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ATG2BQ96BY7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ATG2BQ96BY7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG2BQ96BY7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG2BQ96BY7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG2BQ96BY7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG2BQ96BY7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATG2BQ96BY7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG2BQ96BY7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG2BQ96BY7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG2BQ96BY7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG2BQ96BY7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG2BQ96BY7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG2BQ96BY7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATG2BQ96BY7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG2BQ96BY7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG2BQ96BY7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATG2BQ96BY7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATG2BQ96BY7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG2BQ96BY7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG2BQ96BY7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG2BQ96BY7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG2BQ96BY7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG2BQ96BY7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG2BQ96BY7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG2BQ96BY7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG2BQ96BY7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG2BQ96BY7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG2BQ96BY7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG2BQ96BY7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG2BQ96BY7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG2BQ96BY7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATG2BQ96BY7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG2BQ96BY7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATG2BQ96BY7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATG2BQ96BY7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG2BQ96BY7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG2BQ96BY7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATG2BQ96BY7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATG2BQ96BY7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG2BQ96BY7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG2BQ96BY7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG2BQ96BY7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ATG2BQ96BY7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATG2BQ96BY7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATG2BQ96BY7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATG2BQ96BY7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATG2BQ96BY7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG2BQ96BY7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATG2BQ96BY7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ATG2BQ96BY7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ATG2BQ96BY7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG2BQ96BY7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ATG2BQ96BY7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATG2BQ96BY7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATG2BQ96BY7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG2BQ96BY7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATG2BQ96BY7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATG2BQ96BY7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATG2BQ96BY7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG2BQ96BY7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATG2BQ96BY7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATG2BQ96BY7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATG2BQ96BY7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATG2BQ96BY7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATG2BQ96BY7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATG2BQ96BY7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATG2BQ96BY7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG2BQ96BY7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG2BQ96BY7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATG2BQ96BY7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATG2BQ96BY7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATG2BQ96BY7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG2BQ96BY7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATG2BQ96BY7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms