Protein–RNA interactions for Protein: Q96A83

COL26A1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL26A1Q96A83 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL26A1Q96A83 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL26A1Q96A83 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL26A1Q96A83 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL26A1Q96A83 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL26A1Q96A83 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL26A1Q96A83 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL26A1Q96A83 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL26A1Q96A83 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL26A1Q96A83 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL26A1Q96A83 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL26A1Q96A83 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL26A1Q96A83 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL26A1Q96A83 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL26A1Q96A83 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL26A1Q96A83 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL26A1Q96A83 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL26A1Q96A83 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL26A1Q96A83 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL26A1Q96A83 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL26A1Q96A83 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL26A1Q96A83 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL26A1Q96A83 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL26A1Q96A83 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL26A1Q96A83 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL26A1Q96A83 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COL26A1Q96A83 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COL26A1Q96A83 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL26A1Q96A83 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
COL26A1Q96A83 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL26A1Q96A83 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
COL26A1Q96A83 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL26A1Q96A83 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL26A1Q96A83 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL26A1Q96A83 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL26A1Q96A83 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COL26A1Q96A83 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
COL26A1Q96A83 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COL26A1Q96A83 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL26A1Q96A83 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL26A1Q96A83 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL26A1Q96A83 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL26A1Q96A83 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL26A1Q96A83 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL26A1Q96A83 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL26A1Q96A83 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL26A1Q96A83 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL26A1Q96A83 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL26A1Q96A83 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL26A1Q96A83 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL26A1Q96A83 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL26A1Q96A83 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL26A1Q96A83 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL26A1Q96A83 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL26A1Q96A83 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL26A1Q96A83 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL26A1Q96A83 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL26A1Q96A83 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL26A1Q96A83 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL26A1Q96A83 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL26A1Q96A83 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL26A1Q96A83 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL26A1Q96A83 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL26A1Q96A83 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL26A1Q96A83 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL26A1Q96A83 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL26A1Q96A83 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL26A1Q96A83 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL26A1Q96A83 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL26A1Q96A83 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL26A1Q96A83 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
COL26A1Q96A83 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL26A1Q96A83 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL26A1Q96A83 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COL26A1Q96A83 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COL26A1Q96A83 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL26A1Q96A83 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COL26A1Q96A83 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COL26A1Q96A83 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL26A1Q96A83 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL26A1Q96A83 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL26A1Q96A83 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL26A1Q96A83 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL26A1Q96A83 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL26A1Q96A83 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL26A1Q96A83 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL26A1Q96A83 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL26A1Q96A83 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL26A1Q96A83 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL26A1Q96A83 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COL26A1Q96A83 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL26A1Q96A83 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL26A1Q96A83 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
COL26A1Q96A83 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COL26A1Q96A83 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL26A1Q96A83 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COL26A1Q96A83 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL26A1Q96A83 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL26A1Q96A83 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COL26A1Q96A83 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms