Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PALLDQ8WX93 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PALLDQ8WX93 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
PALLDQ8WX93 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PALLDQ8WX93 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
PALLDQ8WX93 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
PALLDQ8WX93 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
PALLDQ8WX93 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PALLDQ8WX93 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PALLDQ8WX93 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PALLDQ8WX93 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
PALLDQ8WX93 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PALLDQ8WX93 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
PALLDQ8WX93 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PALLDQ8WX93 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PALLDQ8WX93 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PALLDQ8WX93 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PALLDQ8WX93 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PALLDQ8WX93 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PALLDQ8WX93 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PALLDQ8WX93 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PALLDQ8WX93 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PALLDQ8WX93 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PALLDQ8WX93 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PALLDQ8WX93 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PALLDQ8WX93 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PALLDQ8WX93 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
PALLDQ8WX93 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PALLDQ8WX93 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PALLDQ8WX93 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PALLDQ8WX93 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PALLDQ8WX93 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PALLDQ8WX93 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
PALLDQ8WX93 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PALLDQ8WX93 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PALLDQ8WX93 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PALLDQ8WX93 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PALLDQ8WX93 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
PALLDQ8WX93 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PALLDQ8WX93 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PALLDQ8WX93 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PALLDQ8WX93 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PALLDQ8WX93 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PALLDQ8WX93 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PALLDQ8WX93 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PALLDQ8WX93 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PALLDQ8WX93 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PALLDQ8WX93 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PALLDQ8WX93 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PALLDQ8WX93 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
PALLDQ8WX93 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
PALLDQ8WX93 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PALLDQ8WX93 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PALLDQ8WX93 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
PALLDQ8WX93 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
PALLDQ8WX93 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PALLDQ8WX93 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PALLDQ8WX93 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
PALLDQ8WX93 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PALLDQ8WX93 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PALLDQ8WX93 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PALLDQ8WX93 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PALLDQ8WX93 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
PALLDQ8WX93 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PALLDQ8WX93 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PALLDQ8WX93 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PALLDQ8WX93 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.54
PALLDQ8WX93 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PALLDQ8WX93 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PALLDQ8WX93 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PALLDQ8WX93 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PALLDQ8WX93 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
PALLDQ8WX93 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37■■■■□ 3.51
PALLDQ8WX93 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PALLDQ8WX93 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PALLDQ8WX93 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PALLDQ8WX93 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PALLDQ8WX93 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
PALLDQ8WX93 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
PALLDQ8WX93 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PALLDQ8WX93 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
PALLDQ8WX93 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
PALLDQ8WX93 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
PALLDQ8WX93 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
PALLDQ8WX93 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PALLDQ8WX93 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
PALLDQ8WX93 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
PALLDQ8WX93 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
PALLDQ8WX93 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
PALLDQ8WX93 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PALLDQ8WX93 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PALLDQ8WX93 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
PALLDQ8WX93 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PALLDQ8WX93 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
PALLDQ8WX93 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
PALLDQ8WX93 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PALLDQ8WX93 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
PALLDQ8WX93 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
PALLDQ8WX93 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PALLDQ8WX93 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms