Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCA0

LRRC20, Leucine-rich repeat-containing protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC20Q8TCA0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC20Q8TCA0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC20Q8TCA0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC20Q8TCA0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC20Q8TCA0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC20Q8TCA0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC20Q8TCA0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC20Q8TCA0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC20Q8TCA0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC20Q8TCA0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC20Q8TCA0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC20Q8TCA0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC20Q8TCA0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC20Q8TCA0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC20Q8TCA0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC20Q8TCA0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC20Q8TCA0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC20Q8TCA0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC20Q8TCA0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC20Q8TCA0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC20Q8TCA0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC20Q8TCA0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LRRC20Q8TCA0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRC20Q8TCA0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRC20Q8TCA0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRC20Q8TCA0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC20Q8TCA0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRC20Q8TCA0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRC20Q8TCA0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC20Q8TCA0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRC20Q8TCA0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC20Q8TCA0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC20Q8TCA0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRC20Q8TCA0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRC20Q8TCA0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRC20Q8TCA0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC20Q8TCA0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRC20Q8TCA0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRRC20Q8TCA0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC20Q8TCA0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC20Q8TCA0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC20Q8TCA0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC20Q8TCA0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC20Q8TCA0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC20Q8TCA0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC20Q8TCA0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC20Q8TCA0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC20Q8TCA0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC20Q8TCA0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC20Q8TCA0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC20Q8TCA0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC20Q8TCA0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC20Q8TCA0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC20Q8TCA0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC20Q8TCA0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC20Q8TCA0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC20Q8TCA0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC20Q8TCA0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC20Q8TCA0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC20Q8TCA0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC20Q8TCA0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC20Q8TCA0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC20Q8TCA0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC20Q8TCA0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC20Q8TCA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC20Q8TCA0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC20Q8TCA0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC20Q8TCA0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC20Q8TCA0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC20Q8TCA0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC20Q8TCA0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC20Q8TCA0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRC20Q8TCA0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRC20Q8TCA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRC20Q8TCA0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC20Q8TCA0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC20Q8TCA0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms