Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF548Q8NEK5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF548Q8NEK5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZNF548Q8NEK5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZNF548Q8NEK5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZNF548Q8NEK5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF548Q8NEK5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF548Q8NEK5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZNF548Q8NEK5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF548Q8NEK5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF548Q8NEK5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF548Q8NEK5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF548Q8NEK5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF548Q8NEK5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF548Q8NEK5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF548Q8NEK5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF548Q8NEK5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF548Q8NEK5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF548Q8NEK5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF548Q8NEK5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF548Q8NEK5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF548Q8NEK5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF548Q8NEK5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF548Q8NEK5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF548Q8NEK5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF548Q8NEK5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF548Q8NEK5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF548Q8NEK5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF548Q8NEK5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF548Q8NEK5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF548Q8NEK5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF548Q8NEK5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF548Q8NEK5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZNF548Q8NEK5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF548Q8NEK5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZNF548Q8NEK5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZNF548Q8NEK5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF548Q8NEK5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZNF548Q8NEK5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF548Q8NEK5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF548Q8NEK5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF548Q8NEK5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF548Q8NEK5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF548Q8NEK5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF548Q8NEK5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF548Q8NEK5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF548Q8NEK5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF548Q8NEK5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF548Q8NEK5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF548Q8NEK5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF548Q8NEK5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF548Q8NEK5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF548Q8NEK5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZNF548Q8NEK5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF548Q8NEK5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZNF548Q8NEK5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF548Q8NEK5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZNF548Q8NEK5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZNF548Q8NEK5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF548Q8NEK5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZNF548Q8NEK5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF548Q8NEK5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZNF548Q8NEK5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZNF548Q8NEK5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ZNF548Q8NEK5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF548Q8NEK5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ZNF548Q8NEK5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF548Q8NEK5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF548Q8NEK5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF548Q8NEK5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF548Q8NEK5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF548Q8NEK5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF548Q8NEK5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF548Q8NEK5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF548Q8NEK5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF548Q8NEK5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF548Q8NEK5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF548Q8NEK5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF548Q8NEK5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF548Q8NEK5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF548Q8NEK5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ZNF548Q8NEK5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ZNF548Q8NEK5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ZNF548Q8NEK5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ZNF548Q8NEK5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF548Q8NEK5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ZNF548Q8NEK5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ZNF548Q8NEK5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ZNF548Q8NEK5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZNF548Q8NEK5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZNF548Q8NEK5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZNF548Q8NEK5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF548Q8NEK5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZNF548Q8NEK5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF548Q8NEK5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZNF548Q8NEK5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF548Q8NEK5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZNF548Q8NEK5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
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