Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ATAD2Q6PL18 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ATAD2Q6PL18 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ATAD2Q6PL18 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ATAD2Q6PL18 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ATAD2Q6PL18 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ATAD2Q6PL18 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ATAD2Q6PL18 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ATAD2Q6PL18 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ATAD2Q6PL18 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ATAD2Q6PL18 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
ATAD2Q6PL18 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ATAD2Q6PL18 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
ATAD2Q6PL18 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ATAD2Q6PL18 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ATAD2Q6PL18 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
ATAD2Q6PL18 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ATAD2Q6PL18 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
ATAD2Q6PL18 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATAD2Q6PL18 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
ATAD2Q6PL18 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ATAD2Q6PL18 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ATAD2Q6PL18 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
ATAD2Q6PL18 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ATAD2Q6PL18 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
ATAD2Q6PL18 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
ATAD2Q6PL18 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ATAD2Q6PL18 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ATAD2Q6PL18 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ATAD2Q6PL18 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
ATAD2Q6PL18 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ATAD2Q6PL18 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC40.06■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ATAD2Q6PL18 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ATAD2Q6PL18 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
ATAD2Q6PL18 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
ATAD2Q6PL18 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
ATAD2Q6PL18 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
ATAD2Q6PL18 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ATAD2Q6PL18 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
ATAD2Q6PL18 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
ATAD2Q6PL18 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
ATAD2Q6PL18 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
ATAD2Q6PL18 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ATAD2Q6PL18 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
ATAD2Q6PL18 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ATAD2Q6PL18 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
ATAD2Q6PL18 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
ATAD2Q6PL18 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
ATAD2Q6PL18 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
ATAD2Q6PL18 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.57■■■■□ 3.92
ATAD2Q6PL18 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ATAD2Q6PL18 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ATAD2Q6PL18 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ATAD2Q6PL18 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
ATAD2Q6PL18 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ATAD2Q6PL18 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ATAD2Q6PL18 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ATAD2Q6PL18 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
ATAD2Q6PL18 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ATAD2Q6PL18 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ATAD2Q6PL18 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
ATAD2Q6PL18 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
ATAD2Q6PL18 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
ATAD2Q6PL18 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ATAD2Q6PL18 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ATAD2Q6PL18 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
ATAD2Q6PL18 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
ATAD2Q6PL18 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ATAD2Q6PL18 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
ATAD2Q6PL18 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
ATAD2Q6PL18 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
ATAD2Q6PL18 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms