Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
R3HDM1Q15032 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
R3HDM1Q15032 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
R3HDM1Q15032 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
R3HDM1Q15032 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
R3HDM1Q15032 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
R3HDM1Q15032 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
R3HDM1Q15032 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
R3HDM1Q15032 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
R3HDM1Q15032 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
R3HDM1Q15032 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
R3HDM1Q15032 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
R3HDM1Q15032 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
R3HDM1Q15032 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC38.4■■■■□ 3.74
R3HDM1Q15032 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
R3HDM1Q15032 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
R3HDM1Q15032 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
R3HDM1Q15032 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
R3HDM1Q15032 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
R3HDM1Q15032 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.28■■■■□ 3.72
R3HDM1Q15032 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
R3HDM1Q15032 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
R3HDM1Q15032 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
R3HDM1Q15032 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
R3HDM1Q15032 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
R3HDM1Q15032 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
R3HDM1Q15032 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
R3HDM1Q15032 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
R3HDM1Q15032 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
R3HDM1Q15032 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
R3HDM1Q15032 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
R3HDM1Q15032 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
R3HDM1Q15032 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
R3HDM1Q15032 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
R3HDM1Q15032 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
R3HDM1Q15032 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
R3HDM1Q15032 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
R3HDM1Q15032 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
R3HDM1Q15032 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
R3HDM1Q15032 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
R3HDM1Q15032 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
R3HDM1Q15032 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
R3HDM1Q15032 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
R3HDM1Q15032 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
R3HDM1Q15032 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
R3HDM1Q15032 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
R3HDM1Q15032 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
R3HDM1Q15032 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
R3HDM1Q15032 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
R3HDM1Q15032 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
R3HDM1Q15032 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
R3HDM1Q15032 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
R3HDM1Q15032 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
R3HDM1Q15032 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
R3HDM1Q15032 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
R3HDM1Q15032 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
R3HDM1Q15032 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
R3HDM1Q15032 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
R3HDM1Q15032 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
R3HDM1Q15032 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
R3HDM1Q15032 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
R3HDM1Q15032 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
R3HDM1Q15032 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
R3HDM1Q15032 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
R3HDM1Q15032 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
R3HDM1Q15032 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
R3HDM1Q15032 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
R3HDM1Q15032 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.53■■■■□ 3.6
R3HDM1Q15032 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
R3HDM1Q15032 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
R3HDM1Q15032 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
R3HDM1Q15032 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
R3HDM1Q15032 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
R3HDM1Q15032 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
R3HDM1Q15032 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
R3HDM1Q15032 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
R3HDM1Q15032 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
R3HDM1Q15032 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
R3HDM1Q15032 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
R3HDM1Q15032 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
R3HDM1Q15032 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
R3HDM1Q15032 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
R3HDM1Q15032 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
R3HDM1Q15032 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
R3HDM1Q15032 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
R3HDM1Q15032 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
R3HDM1Q15032 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
R3HDM1Q15032 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
R3HDM1Q15032 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
R3HDM1Q15032 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
R3HDM1Q15032 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
R3HDM1Q15032 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
R3HDM1Q15032 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
R3HDM1Q15032 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
R3HDM1Q15032 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
R3HDM1Q15032 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
R3HDM1Q15032 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
R3HDM1Q15032 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
R3HDM1Q15032 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
R3HDM1Q15032 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms