Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL9A2Q14055 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL9A2Q14055 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL9A2Q14055 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL9A2Q14055 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COL9A2Q14055 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL9A2Q14055 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL9A2Q14055 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL9A2Q14055 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL9A2Q14055 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A2Q14055 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL9A2Q14055 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COL9A2Q14055 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL9A2Q14055 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL9A2Q14055 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL9A2Q14055 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A2Q14055 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL9A2Q14055 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL9A2Q14055 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL9A2Q14055 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL9A2Q14055 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL9A2Q14055 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL9A2Q14055 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL9A2Q14055 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
COL9A2Q14055 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL9A2Q14055 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL9A2Q14055 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL9A2Q14055 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL9A2Q14055 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL9A2Q14055 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
COL9A2Q14055 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
COL9A2Q14055 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COL9A2Q14055 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
COL9A2Q14055 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A2Q14055 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COL9A2Q14055 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A2Q14055 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
COL9A2Q14055 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COL9A2Q14055 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COL9A2Q14055 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL9A2Q14055 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL9A2Q14055 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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