Protein–RNA interactions for Protein: Q14019

COTL1, Coactosin-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COTL1Q14019 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COTL1Q14019 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COTL1Q14019 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
COTL1Q14019 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COTL1Q14019 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COTL1Q14019 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COTL1Q14019 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COTL1Q14019 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COTL1Q14019 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COTL1Q14019 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
COTL1Q14019 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
COTL1Q14019 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
COTL1Q14019 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COTL1Q14019 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COTL1Q14019 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COTL1Q14019 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COTL1Q14019 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COTL1Q14019 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COTL1Q14019 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
COTL1Q14019 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COTL1Q14019 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
COTL1Q14019 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COTL1Q14019 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COTL1Q14019 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COTL1Q14019 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COTL1Q14019 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COTL1Q14019 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COTL1Q14019 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
COTL1Q14019 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COTL1Q14019 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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