Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMK2BQ13554 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CAMK2BQ13554 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMK2BQ13554 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CAMK2BQ13554 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMK2BQ13554 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CAMK2BQ13554 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CAMK2BQ13554 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMK2BQ13554 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CAMK2BQ13554 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CAMK2BQ13554 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CAMK2BQ13554 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CAMK2BQ13554 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CAMK2BQ13554 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAMK2BQ13554 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAMK2BQ13554 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAMK2BQ13554 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAMK2BQ13554 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAMK2BQ13554 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAMK2BQ13554 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAMK2BQ13554 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CAMK2BQ13554 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAMK2BQ13554 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMK2BQ13554 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAMK2BQ13554 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMK2BQ13554 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAMK2BQ13554 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CAMK2BQ13554 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CAMK2BQ13554 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CAMK2BQ13554 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAMK2BQ13554 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAMK2BQ13554 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CAMK2BQ13554 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMK2BQ13554 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMK2BQ13554 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAMK2BQ13554 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMK2BQ13554 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAMK2BQ13554 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAMK2BQ13554 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAMK2BQ13554 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAMK2BQ13554 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAMK2BQ13554 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAMK2BQ13554 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAMK2BQ13554 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAMK2BQ13554 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAMK2BQ13554 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CAMK2BQ13554 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMK2BQ13554 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMK2BQ13554 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMK2BQ13554 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAMK2BQ13554 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAMK2BQ13554 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMK2BQ13554 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMK2BQ13554 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAMK2BQ13554 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAMK2BQ13554 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAMK2BQ13554 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAMK2BQ13554 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMK2BQ13554 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMK2BQ13554 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAMK2BQ13554 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAMK2BQ13554 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CAMK2BQ13554 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CAMK2BQ13554 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAMK2BQ13554 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CAMK2BQ13554 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CAMK2BQ13554 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAMK2BQ13554 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAMK2BQ13554 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAMK2BQ13554 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAMK2BQ13554 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMK2BQ13554 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMK2BQ13554 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAMK2BQ13554 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMK2BQ13554 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMK2BQ13554 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMK2BQ13554 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAMK2BQ13554 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMK2BQ13554 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMK2BQ13554 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAMK2BQ13554 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAMK2BQ13554 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CAMK2BQ13554 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAMK2BQ13554 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAMK2BQ13554 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMK2BQ13554 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAMK2BQ13554 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAMK2BQ13554 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAMK2BQ13554 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAMK2BQ13554 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMK2BQ13554 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAMK2BQ13554 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAMK2BQ13554 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CAMK2BQ13554 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAMK2BQ13554 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAMK2BQ13554 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAMK2BQ13554 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAMK2BQ13554 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAMK2BQ13554 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CAMK2BQ13554 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms