Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATRQ13535 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRQ13535 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRQ13535 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRQ13535 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRQ13535 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRQ13535 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRQ13535 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRQ13535 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRQ13535 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRQ13535 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATRQ13535 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRQ13535 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATRQ13535 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATRQ13535 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRQ13535 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRQ13535 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATRQ13535 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATRQ13535 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRQ13535 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATRQ13535 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATRQ13535 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATRQ13535 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATRQ13535 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATRQ13535 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATRQ13535 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRQ13535 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATRQ13535 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATRQ13535 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATRQ13535 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRQ13535 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATRQ13535 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATRQ13535 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATRQ13535 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRQ13535 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRQ13535 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATRQ13535 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATRQ13535 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRQ13535 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRQ13535 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATRQ13535 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRQ13535 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRQ13535 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRQ13535 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATRQ13535 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATRQ13535 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATRQ13535 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATRQ13535 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRQ13535 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATRQ13535 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRQ13535 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATRQ13535 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRQ13535 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRQ13535 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATRQ13535 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATRQ13535 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRQ13535 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRQ13535 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRQ13535 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRQ13535 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRQ13535 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRQ13535 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATRQ13535 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATRQ13535 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRQ13535 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRQ13535 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATRQ13535 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATRQ13535 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATRQ13535 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRQ13535 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATRQ13535 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATRQ13535 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATRQ13535 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATRQ13535 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRQ13535 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATRQ13535 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATRQ13535 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
ATRQ13535 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRQ13535 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATRQ13535 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRQ13535 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRQ13535 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATRQ13535 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRQ13535 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRQ13535 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATRQ13535 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATRQ13535 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATRQ13535 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATRQ13535 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRQ13535 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATRQ13535 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATRQ13535 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATRQ13535 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATRQ13535 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATRQ13535 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATRQ13535 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATRQ13535 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATRQ13535 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATRQ13535 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATRQ13535 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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