Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SRSF5Q13243 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRSF5Q13243 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SRSF5Q13243 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRSF5Q13243 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRSF5Q13243 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRSF5Q13243 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRSF5Q13243 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRSF5Q13243 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRSF5Q13243 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRSF5Q13243 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRSF5Q13243 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRSF5Q13243 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SRSF5Q13243 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRSF5Q13243 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRSF5Q13243 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRSF5Q13243 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRSF5Q13243 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRSF5Q13243 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SRSF5Q13243 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRSF5Q13243 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRSF5Q13243 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRSF5Q13243 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRSF5Q13243 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRSF5Q13243 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SRSF5Q13243 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRSF5Q13243 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRSF5Q13243 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SRSF5Q13243 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRSF5Q13243 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SRSF5Q13243 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRSF5Q13243 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SRSF5Q13243 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRSF5Q13243 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRSF5Q13243 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRSF5Q13243 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRSF5Q13243 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRSF5Q13243 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRSF5Q13243 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRSF5Q13243 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRSF5Q13243 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRSF5Q13243 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRSF5Q13243 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRSF5Q13243 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRSF5Q13243 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRSF5Q13243 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRSF5Q13243 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRSF5Q13243 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRSF5Q13243 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SRSF5Q13243 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRSF5Q13243 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRSF5Q13243 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRSF5Q13243 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SRSF5Q13243 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRSF5Q13243 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRSF5Q13243 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SRSF5Q13243 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRSF5Q13243 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRSF5Q13243 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRSF5Q13243 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRSF5Q13243 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRSF5Q13243 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRSF5Q13243 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRSF5Q13243 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRSF5Q13243 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRSF5Q13243 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRSF5Q13243 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRSF5Q13243 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SRSF5Q13243 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRSF5Q13243 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SRSF5Q13243 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRSF5Q13243 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRSF5Q13243 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRSF5Q13243 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRSF5Q13243 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRSF5Q13243 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRSF5Q13243 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRSF5Q13243 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRSF5Q13243 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRSF5Q13243 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRSF5Q13243 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRSF5Q13243 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SRSF5Q13243 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SRSF5Q13243 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRSF5Q13243 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRSF5Q13243 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRSF5Q13243 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SRSF5Q13243 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRSF5Q13243 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRSF5Q13243 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
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