Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TRIM32Q13049 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM32Q13049 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM32Q13049 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
TRIM32Q13049 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM32Q13049 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM32Q13049 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TRIM32Q13049 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TRIM32Q13049 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM32Q13049 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TRIM32Q13049 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM32Q13049 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM32Q13049 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM32Q13049 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TRIM32Q13049 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TRIM32Q13049 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM32Q13049 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TRIM32Q13049 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM32Q13049 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRIM32Q13049 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRIM32Q13049 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM32Q13049 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TRIM32Q13049 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
TRIM32Q13049 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
TRIM32Q13049 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM32Q13049 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM32Q13049 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM32Q13049 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM32Q13049 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM32Q13049 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM32Q13049 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM32Q13049 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM32Q13049 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TRIM32Q13049 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM32Q13049 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM32Q13049 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TRIM32Q13049 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM32Q13049 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
TRIM32Q13049 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM32Q13049 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRIM32Q13049 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM32Q13049 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
TRIM32Q13049 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM32Q13049 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRIM32Q13049 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM32Q13049 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM32Q13049 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRIM32Q13049 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRIM32Q13049 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRIM32Q13049 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRIM32Q13049 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRIM32Q13049 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRIM32Q13049 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRIM32Q13049 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRIM32Q13049 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRIM32Q13049 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM32Q13049 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM32Q13049 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM32Q13049 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM32Q13049 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM32Q13049 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRIM32Q13049 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRIM32Q13049 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRIM32Q13049 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRIM32Q13049 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM32Q13049 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
TRIM32Q13049 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRIM32Q13049 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRIM32Q13049 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRIM32Q13049 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM32Q13049 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM32Q13049 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM32Q13049 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM32Q13049 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM32Q13049 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM32Q13049 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM32Q13049 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM32Q13049 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM32Q13049 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM32Q13049 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM32Q13049 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM32Q13049 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM32Q13049 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM32Q13049 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM32Q13049 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
TRIM32Q13049 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM32Q13049 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM32Q13049 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM32Q13049 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM32Q13049 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM32Q13049 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRIM32Q13049 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM32Q13049 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM32Q13049 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM32Q13049 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM32Q13049 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM32Q13049 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRIM32Q13049 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM32Q13049 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRIM32Q13049 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms