Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ILF3Q12906 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 45.2
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ILF3Q12906 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.992e-13■■■■■ 45.1
ILF3Q12906 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.072e-13■■■■■ 45.1
ILF3Q12906 FNDC3A-203ENST00000484074 6082 ntTSL 1 (best)4.09□□□□□ -1.752e-13■■■■■ 45.1
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ILF3Q12906 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-13■■■■■ 44.7
ILF3Q12906 NDRG1-223ENST00000522665 411 ntTSL 214.75□□□□□ -0.053e-13■■■■■ 44.7
ILF3Q12906 NDRG1-217ENST00000521414 2349 ntTSL 213.92□□□□□ -0.183e-13■■■■■ 44.7
ILF3Q12906 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-13■■■■■ 44.7
ILF3Q12906 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-13■■■■■ 44.7
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ILF3Q12906 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.733e-13■■■■■ 44.7
ILF3Q12906 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-13■■■■■ 44.7
ILF3Q12906 NDRG1-212ENST00000519278 3983 ntTSL 29.07□□□□□ -0.963e-13■■■■■ 44.7
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ILF3Q12906 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.181e-13■■■■■ 44.2
ILF3Q12906 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.371e-13■■■■■ 44.2
ILF3Q12906 ZNF44-205ENST00000397742 2372 ntTSL 213.66□□□□□ -0.228e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.428e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 ZNF44-201ENST00000354656 517 ntTSL 311.6□□□□□ -0.558e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 ZNF44-208ENST00000600003 2051 ntTSL 211.2□□□□□ -0.628e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 ZNF44-203ENST00000356109 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.698e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 ZNF44-204ENST00000393337 3236 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.048e-7■■■■■ 44.1
ILF3Q12906 JMJD1C-211ENST00000633035 499 ntTSL 316.51■□□□□ 0.234e-8■■■■■ 43.4
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