Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC50.98■■■■■ 5.75
ABCC8Q09428 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC50.98■■■■■ 5.75
ABCC8Q09428 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC50.98■■■■■ 5.75
ABCC8Q09428 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
ABCC8Q09428 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
ABCC8Q09428 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC50.89■■■■■ 5.74
ABCC8Q09428 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.88■■■■■ 5.74
ABCC8Q09428 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC50.85■■■■■ 5.73
ABCC8Q09428 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC50.84■■■■■ 5.73
ABCC8Q09428 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC50.82■■■■■ 5.73
ABCC8Q09428 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.79■■■■■ 5.72
ABCC8Q09428 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
ABCC8Q09428 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.74■■■■■ 5.71
ABCC8Q09428 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
ABCC8Q09428 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC50.6■■■■■ 5.69
ABCC8Q09428 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC50.6■■■■■ 5.69
ABCC8Q09428 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC50.55■■■■■ 5.68
ABCC8Q09428 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC50.53■■■■■ 5.68
ABCC8Q09428 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC50.53■■■■■ 5.68
ABCC8Q09428 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.52■■■■■ 5.68
ABCC8Q09428 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.51■■■■■ 5.68
ABCC8Q09428 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.41■■■■■ 5.66
ABCC8Q09428 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
ABCC8Q09428 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
ABCC8Q09428 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.32■■■■■ 5.65
ABCC8Q09428 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC50.25■■■■■ 5.63
ABCC8Q09428 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC50.21■■■■■ 5.63
ABCC8Q09428 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC50.15■■■■■ 5.62
ABCC8Q09428 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC50.13■■■■■ 5.61
ABCC8Q09428 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC50.1■■■■■ 5.61
ABCC8Q09428 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.09■■■■■ 5.61
ABCC8Q09428 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.07■■■■■ 5.61
ABCC8Q09428 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
ABCC8Q09428 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC50.01■■■■■ 5.6
ABCC8Q09428 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
ABCC8Q09428 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
ABCC8Q09428 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC49.97■■■■■ 5.59
ABCC8Q09428 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.96■■■■■ 5.59
ABCC8Q09428 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC49.94■■■■■ 5.59
ABCC8Q09428 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC49.88■■■■■ 5.58
ABCC8Q09428 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
ABCC8Q09428 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC49.83■■■■■ 5.57
ABCC8Q09428 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.83■■■■■ 5.57
ABCC8Q09428 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
ABCC8Q09428 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC49.82■■■■■ 5.57
ABCC8Q09428 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC49.78■■■■■ 5.56
ABCC8Q09428 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
ABCC8Q09428 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC49.74■■■■■ 5.55
ABCC8Q09428 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.54
ABCC8Q09428 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.69■■■■■ 5.54
ABCC8Q09428 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC49.67■■■■■ 5.54
ABCC8Q09428 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC49.67■■■■■ 5.54
ABCC8Q09428 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC49.67■■■■■ 5.54
ABCC8Q09428 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC49.66■■■■■ 5.54
ABCC8Q09428 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC49.65■■■■■ 5.54
ABCC8Q09428 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
ABCC8Q09428 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
ABCC8Q09428 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
ABCC8Q09428 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC49.57■■■■■ 5.53
ABCC8Q09428 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
ABCC8Q09428 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
ABCC8Q09428 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.51■■■■■ 5.52
ABCC8Q09428 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC49.49■■■■■ 5.51
ABCC8Q09428 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.47■■■■■ 5.51
ABCC8Q09428 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.45■■■■■ 5.51
ABCC8Q09428 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
ABCC8Q09428 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
ABCC8Q09428 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.36■■■■■ 5.49
ABCC8Q09428 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
ABCC8Q09428 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC49.24■■■■■ 5.47
ABCC8Q09428 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.22■■■■■ 5.47
ABCC8Q09428 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC49.2■■■■■ 5.47
ABCC8Q09428 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.18■■■■■ 5.46
ABCC8Q09428 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.15■■■■■ 5.46
ABCC8Q09428 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC49.15■■■■■ 5.46
ABCC8Q09428 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC49.12■■■■■ 5.45
ABCC8Q09428 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC49.1■■■■■ 5.45
ABCC8Q09428 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC49.09■■■■■ 5.45
ABCC8Q09428 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC49.09■■■■■ 5.45
ABCC8Q09428 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
ABCC8Q09428 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.08■■■■■ 5.45
ABCC8Q09428 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.04■■■■■ 5.44
ABCC8Q09428 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
ABCC8Q09428 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC49.03■■■■■ 5.44
ABCC8Q09428 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC49.02■■■■■ 5.44
ABCC8Q09428 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
ABCC8Q09428 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
ABCC8Q09428 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
ABCC8Q09428 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC48.95■■■■■ 5.43
ABCC8Q09428 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
ABCC8Q09428 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
ABCC8Q09428 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC48.91■■■■■ 5.42
ABCC8Q09428 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.88■■■■■ 5.42
ABCC8Q09428 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.87■■■■■ 5.41
ABCC8Q09428 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC48.86■■■■■ 5.41
ABCC8Q09428 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
ABCC8Q09428 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
ABCC8Q09428 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
ABCC8Q09428 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC48.8■■■■■ 5.4
ABCC8Q09428 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.77■■■■■ 5.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms