Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ITIH3Q06033 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
ITIH3Q06033 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ITIH3Q06033 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ITIH3Q06033 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ITIH3Q06033 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ITIH3Q06033 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ITIH3Q06033 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ITIH3Q06033 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ITIH3Q06033 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITIH3Q06033 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ITIH3Q06033 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
ITIH3Q06033 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ITIH3Q06033 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ITIH3Q06033 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITIH3Q06033 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITIH3Q06033 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ITIH3Q06033 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ITIH3Q06033 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ITIH3Q06033 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ITIH3Q06033 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ITIH3Q06033 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITIH3Q06033 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ITIH3Q06033 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ITIH3Q06033 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ITIH3Q06033 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ITIH3Q06033 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ITIH3Q06033 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITIH3Q06033 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ITIH3Q06033 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITIH3Q06033 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ITIH3Q06033 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ITIH3Q06033 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITIH3Q06033 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITIH3Q06033 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ITIH3Q06033 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITIH3Q06033 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITIH3Q06033 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ITIH3Q06033 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITIH3Q06033 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITIH3Q06033 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITIH3Q06033 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ITIH3Q06033 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ITIH3Q06033 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITIH3Q06033 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ITIH3Q06033 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ITIH3Q06033 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ITIH3Q06033 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ITIH3Q06033 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ITIH3Q06033 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ITIH3Q06033 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ITIH3Q06033 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ITIH3Q06033 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ITIH3Q06033 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ITIH3Q06033 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITIH3Q06033 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITIH3Q06033 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITIH3Q06033 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ITIH3Q06033 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ITIH3Q06033 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITIH3Q06033 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ITIH3Q06033 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ITIH3Q06033 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ITIH3Q06033 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ITIH3Q06033 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ITIH3Q06033 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITIH3Q06033 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ITIH3Q06033 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ITIH3Q06033 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ITIH3Q06033 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ITIH3Q06033 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ITIH3Q06033 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ITIH3Q06033 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITIH3Q06033 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ITIH3Q06033 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITIH3Q06033 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ITIH3Q06033 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ITIH3Q06033 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
ITIH3Q06033 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ITIH3Q06033 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ITIH3Q06033 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITIH3Q06033 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ITIH3Q06033 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITIH3Q06033 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITIH3Q06033 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ITIH3Q06033 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ITIH3Q06033 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITIH3Q06033 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ITIH3Q06033 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITIH3Q06033 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITIH3Q06033 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITIH3Q06033 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ITIH3Q06033 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITIH3Q06033 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITIH3Q06033 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITIH3Q06033 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITIH3Q06033 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ITIH3Q06033 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITIH3Q06033 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITIH3Q06033 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms