Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIM1P81133 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIM1P81133 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SIM1P81133 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIM1P81133 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIM1P81133 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIM1P81133 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIM1P81133 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIM1P81133 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIM1P81133 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIM1P81133 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIM1P81133 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIM1P81133 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIM1P81133 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIM1P81133 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIM1P81133 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIM1P81133 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SIM1P81133 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIM1P81133 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIM1P81133 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIM1P81133 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SIM1P81133 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIM1P81133 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SIM1P81133 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIM1P81133 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIM1P81133 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIM1P81133 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SIM1P81133 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SIM1P81133 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SIM1P81133 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SIM1P81133 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIM1P81133 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIM1P81133 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIM1P81133 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SIM1P81133 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SIM1P81133 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIM1P81133 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIM1P81133 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIM1P81133 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIM1P81133 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIM1P81133 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SIM1P81133 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SIM1P81133 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SIM1P81133 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIM1P81133 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIM1P81133 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIM1P81133 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIM1P81133 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SIM1P81133 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SIM1P81133 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SIM1P81133 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIM1P81133 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIM1P81133 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIM1P81133 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIM1P81133 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIM1P81133 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIM1P81133 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIM1P81133 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIM1P81133 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIM1P81133 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIM1P81133 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIM1P81133 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIM1P81133 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIM1P81133 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIM1P81133 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIM1P81133 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIM1P81133 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIM1P81133 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIM1P81133 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIM1P81133 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIM1P81133 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SIM1P81133 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SIM1P81133 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIM1P81133 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SIM1P81133 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SIM1P81133 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SIM1P81133 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SIM1P81133 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIM1P81133 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SIM1P81133 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SIM1P81133 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIM1P81133 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIM1P81133 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIM1P81133 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIM1P81133 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIM1P81133 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SIM1P81133 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIM1P81133 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIM1P81133 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SIM1P81133 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIM1P81133 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIM1P81133 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIM1P81133 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIM1P81133 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIM1P81133 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIM1P81133 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIM1P81133 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIM1P81133 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIM1P81133 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIM1P81133 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms