Protein–RNA interactions for Protein: P55089

UCN, Urocortin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCNP55089 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UCNP55089 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UCNP55089 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UCNP55089 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
UCNP55089 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UCNP55089 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UCNP55089 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UCNP55089 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UCNP55089 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UCNP55089 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UCNP55089 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UCNP55089 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UCNP55089 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UCNP55089 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UCNP55089 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UCNP55089 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UCNP55089 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UCNP55089 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UCNP55089 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UCNP55089 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UCNP55089 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
UCNP55089 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UCNP55089 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UCNP55089 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UCNP55089 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UCNP55089 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UCNP55089 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UCNP55089 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UCNP55089 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UCNP55089 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
UCNP55089 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UCNP55089 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UCNP55089 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UCNP55089 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UCNP55089 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UCNP55089 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UCNP55089 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UCNP55089 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UCNP55089 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UCNP55089 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UCNP55089 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UCNP55089 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UCNP55089 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UCNP55089 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UCNP55089 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UCNP55089 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UCNP55089 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UCNP55089 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UCNP55089 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UCNP55089 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UCNP55089 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UCNP55089 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UCNP55089 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UCNP55089 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UCNP55089 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UCNP55089 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UCNP55089 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
UCNP55089 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UCNP55089 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UCNP55089 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UCNP55089 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UCNP55089 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
UCNP55089 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
UCNP55089 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
UCNP55089 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
UCNP55089 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UCNP55089 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UCNP55089 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
UCNP55089 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
UCNP55089 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
UCNP55089 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UCNP55089 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UCNP55089 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
UCNP55089 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
UCNP55089 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UCNP55089 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UCNP55089 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UCNP55089 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UCNP55089 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UCNP55089 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UCNP55089 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UCNP55089 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UCNP55089 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UCNP55089 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UCNP55089 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UCNP55089 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UCNP55089 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UCNP55089 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UCNP55089 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UCNP55089 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UCNP55089 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
UCNP55089 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UCNP55089 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UCNP55089 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UCNP55089 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UCNP55089 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
UCNP55089 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UCNP55089 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UCNP55089 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UCNP55089 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms