Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RRADP55042 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RRADP55042 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RRADP55042 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RRADP55042 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRADP55042 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RRADP55042 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RRADP55042 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RRADP55042 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRADP55042 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RRADP55042 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRADP55042 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRADP55042 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRADP55042 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRADP55042 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRADP55042 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRADP55042 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRADP55042 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RRADP55042 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RRADP55042 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRADP55042 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RRADP55042 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RRADP55042 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RRADP55042 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RRADP55042 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRADP55042 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RRADP55042 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRADP55042 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RRADP55042 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RRADP55042 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RRADP55042 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RRADP55042 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRADP55042 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RRADP55042 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RRADP55042 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRADP55042 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RRADP55042 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRADP55042 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRADP55042 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRADP55042 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRADP55042 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRADP55042 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRADP55042 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRADP55042 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRADP55042 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRADP55042 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RRADP55042 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRADP55042 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RRADP55042 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRADP55042 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RRADP55042 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RRADP55042 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RRADP55042 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRADP55042 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RRADP55042 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RRADP55042 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRADP55042 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RRADP55042 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RRADP55042 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RRADP55042 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RRADP55042 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RRADP55042 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RRADP55042 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RRADP55042 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRADP55042 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RRADP55042 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRADP55042 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RRADP55042 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRADP55042 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RRADP55042 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRADP55042 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRADP55042 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RRADP55042 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRADP55042 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RRADP55042 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRADP55042 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RRADP55042 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RRADP55042 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRADP55042 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRADP55042 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRADP55042 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RRADP55042 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRADP55042 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRADP55042 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RRADP55042 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRADP55042 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRADP55042 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRADP55042 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRADP55042 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRADP55042 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRADP55042 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRADP55042 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRADP55042 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRADP55042 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRADP55042 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRADP55042 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRADP55042 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRADP55042 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRADP55042 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRADP55042 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms