Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AP2S1P53680 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AP2S1P53680 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AP2S1P53680 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AP2S1P53680 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AP2S1P53680 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP2S1P53680 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP2S1P53680 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AP2S1P53680 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AP2S1P53680 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AP2S1P53680 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP2S1P53680 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP2S1P53680 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP2S1P53680 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP2S1P53680 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP2S1P53680 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP2S1P53680 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP2S1P53680 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP2S1P53680 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP2S1P53680 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP2S1P53680 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP2S1P53680 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP2S1P53680 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP2S1P53680 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP2S1P53680 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP2S1P53680 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP2S1P53680 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP2S1P53680 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP2S1P53680 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP2S1P53680 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AP2S1P53680 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AP2S1P53680 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AP2S1P53680 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP2S1P53680 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP2S1P53680 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AP2S1P53680 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP2S1P53680 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP2S1P53680 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AP2S1P53680 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AP2S1P53680 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AP2S1P53680 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP2S1P53680 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP2S1P53680 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AP2S1P53680 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP2S1P53680 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AP2S1P53680 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP2S1P53680 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AP2S1P53680 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AP2S1P53680 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP2S1P53680 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP2S1P53680 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP2S1P53680 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP2S1P53680 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP2S1P53680 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP2S1P53680 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP2S1P53680 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP2S1P53680 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP2S1P53680 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP2S1P53680 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP2S1P53680 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP2S1P53680 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP2S1P53680 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP2S1P53680 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP2S1P53680 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP2S1P53680 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP2S1P53680 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP2S1P53680 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP2S1P53680 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP2S1P53680 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP2S1P53680 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP2S1P53680 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AP2S1P53680 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP2S1P53680 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP2S1P53680 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP2S1P53680 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP2S1P53680 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP2S1P53680 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP2S1P53680 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP2S1P53680 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP2S1P53680 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP2S1P53680 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP2S1P53680 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP2S1P53680 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP2S1P53680 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP2S1P53680 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP2S1P53680 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP2S1P53680 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP2S1P53680 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP2S1P53680 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP2S1P53680 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms