Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KNTC1P50748 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KNTC1P50748 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KNTC1P50748 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
KNTC1P50748 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KNTC1P50748 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KNTC1P50748 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KNTC1P50748 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KNTC1P50748 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KNTC1P50748 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KNTC1P50748 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KNTC1P50748 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KNTC1P50748 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KNTC1P50748 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KNTC1P50748 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KNTC1P50748 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KNTC1P50748 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KNTC1P50748 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNTC1P50748 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNTC1P50748 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KNTC1P50748 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KNTC1P50748 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KNTC1P50748 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KNTC1P50748 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KNTC1P50748 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KNTC1P50748 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KNTC1P50748 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KNTC1P50748 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KNTC1P50748 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KNTC1P50748 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KNTC1P50748 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KNTC1P50748 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KNTC1P50748 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNTC1P50748 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KNTC1P50748 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KNTC1P50748 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KNTC1P50748 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KNTC1P50748 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KNTC1P50748 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KNTC1P50748 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNTC1P50748 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KNTC1P50748 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KNTC1P50748 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KNTC1P50748 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNTC1P50748 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KNTC1P50748 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNTC1P50748 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KNTC1P50748 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KNTC1P50748 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KNTC1P50748 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KNTC1P50748 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KNTC1P50748 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNTC1P50748 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KNTC1P50748 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KNTC1P50748 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNTC1P50748 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KNTC1P50748 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KNTC1P50748 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNTC1P50748 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KNTC1P50748 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNTC1P50748 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KNTC1P50748 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KNTC1P50748 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNTC1P50748 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KNTC1P50748 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KNTC1P50748 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KNTC1P50748 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KNTC1P50748 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNTC1P50748 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KNTC1P50748 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KNTC1P50748 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KNTC1P50748 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KNTC1P50748 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KNTC1P50748 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KNTC1P50748 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KNTC1P50748 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KNTC1P50748 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNTC1P50748 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KNTC1P50748 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KNTC1P50748 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KNTC1P50748 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNTC1P50748 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNTC1P50748 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KNTC1P50748 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KNTC1P50748 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNTC1P50748 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNTC1P50748 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KNTC1P50748 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms