Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PI4KAP42356 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PI4KAP42356 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PI4KAP42356 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PI4KAP42356 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PI4KAP42356 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PI4KAP42356 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PI4KAP42356 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PI4KAP42356 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PI4KAP42356 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PI4KAP42356 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PI4KAP42356 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PI4KAP42356 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PI4KAP42356 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PI4KAP42356 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PI4KAP42356 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PI4KAP42356 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PI4KAP42356 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PI4KAP42356 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PI4KAP42356 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PI4KAP42356 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PI4KAP42356 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PI4KAP42356 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PI4KAP42356 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PI4KAP42356 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PI4KAP42356 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PI4KAP42356 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PI4KAP42356 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PI4KAP42356 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PI4KAP42356 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PI4KAP42356 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PI4KAP42356 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PI4KAP42356 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PI4KAP42356 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PI4KAP42356 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PI4KAP42356 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PI4KAP42356 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PI4KAP42356 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PI4KAP42356 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PI4KAP42356 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PI4KAP42356 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PI4KAP42356 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PI4KAP42356 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PI4KAP42356 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PI4KAP42356 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PI4KAP42356 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PI4KAP42356 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PI4KAP42356 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PI4KAP42356 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PI4KAP42356 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PI4KAP42356 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PI4KAP42356 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PI4KAP42356 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PI4KAP42356 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PI4KAP42356 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PI4KAP42356 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PI4KAP42356 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PI4KAP42356 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PI4KAP42356 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PI4KAP42356 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PI4KAP42356 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PI4KAP42356 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PI4KAP42356 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PI4KAP42356 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PI4KAP42356 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PI4KAP42356 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PI4KAP42356 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PI4KAP42356 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PI4KAP42356 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PI4KAP42356 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PI4KAP42356 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PI4KAP42356 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PI4KAP42356 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PI4KAP42356 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PI4KAP42356 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PI4KAP42356 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PI4KAP42356 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PI4KAP42356 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PI4KAP42356 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PI4KAP42356 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PI4KAP42356 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PI4KAP42356 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PI4KAP42356 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PI4KAP42356 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PI4KAP42356 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PI4KAP42356 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PI4KAP42356 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PI4KAP42356 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PI4KAP42356 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PI4KAP42356 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PI4KAP42356 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PI4KAP42356 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PI4KAP42356 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PI4KAP42356 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4KAP42356 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PI4KAP42356 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP42356 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PI4KAP42356 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PI4KAP42356 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PI4KAP42356 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms