Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HOXD11P31277 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HOXD11P31277 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXD11P31277 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXD11P31277 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
HOXD11P31277 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXD11P31277 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HOXD11P31277 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HOXD11P31277 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HOXD11P31277 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
HOXD11P31277 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HOXD11P31277 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HOXD11P31277 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HOXD11P31277 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXD11P31277 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HOXD11P31277 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HOXD11P31277 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HOXD11P31277 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HOXD11P31277 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HOXD11P31277 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXD11P31277 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HOXD11P31277 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXD11P31277 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXD11P31277 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXD11P31277 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXD11P31277 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXD11P31277 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXD11P31277 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXD11P31277 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXD11P31277 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXD11P31277 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXD11P31277 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXD11P31277 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXD11P31277 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXD11P31277 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXD11P31277 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXD11P31277 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXD11P31277 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HOXD11P31277 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HOXD11P31277 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HOXD11P31277 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXD11P31277 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXD11P31277 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXD11P31277 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXD11P31277 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXD11P31277 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXD11P31277 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXD11P31277 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXD11P31277 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXD11P31277 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD11P31277 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXD11P31277 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXD11P31277 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXD11P31277 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD11P31277 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD11P31277 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD11P31277 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms