Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNB4P30926 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNB4P30926 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHRNB4P30926 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB4P30926 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB4P30926 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHRNB4P30926 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHRNB4P30926 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHRNB4P30926 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB4P30926 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHRNB4P30926 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNB4P30926 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHRNB4P30926 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHRNB4P30926 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHRNB4P30926 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHRNB4P30926 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNB4P30926 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNB4P30926 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNB4P30926 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHRNB4P30926 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNB4P30926 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHRNB4P30926 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNB4P30926 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHRNB4P30926 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNB4P30926 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHRNB4P30926 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNB4P30926 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRNB4P30926 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRNB4P30926 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRNB4P30926 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRNB4P30926 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNB4P30926 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRNB4P30926 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNB4P30926 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRNB4P30926 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNB4P30926 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNB4P30926 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNB4P30926 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNB4P30926 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNB4P30926 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRNB4P30926 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNB4P30926 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRNB4P30926 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNB4P30926 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNB4P30926 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRNB4P30926 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNB4P30926 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHRNB4P30926 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHRNB4P30926 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB4P30926 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB4P30926 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB4P30926 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHRNB4P30926 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHRNB4P30926 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNB4P30926 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNB4P30926 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNB4P30926 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNB4P30926 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNB4P30926 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNB4P30926 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNB4P30926 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB4P30926 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNB4P30926 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNB4P30926 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNB4P30926 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNB4P30926 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHRNB4P30926 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNB4P30926 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHRNB4P30926 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHRNB4P30926 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CHRNB4P30926 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNB4P30926 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNB4P30926 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHRNB4P30926 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB4P30926 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHRNB4P30926 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHRNB4P30926 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHRNB4P30926 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHRNB4P30926 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHRNB4P30926 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB4P30926 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB4P30926 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNB4P30926 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNB4P30926 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNB4P30926 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB4P30926 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB4P30926 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB4P30926 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB4P30926 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB4P30926 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms