Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRF1P14222 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRF1P14222 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRF1P14222 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRF1P14222 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRF1P14222 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRF1P14222 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRF1P14222 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRF1P14222 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRF1P14222 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRF1P14222 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRF1P14222 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRF1P14222 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRF1P14222 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRF1P14222 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRF1P14222 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRF1P14222 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRF1P14222 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRF1P14222 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRF1P14222 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRF1P14222 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRF1P14222 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRF1P14222 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRF1P14222 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRF1P14222 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRF1P14222 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRF1P14222 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRF1P14222 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRF1P14222 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRF1P14222 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRF1P14222 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRF1P14222 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRF1P14222 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRF1P14222 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRF1P14222 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRF1P14222 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRF1P14222 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRF1P14222 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRF1P14222 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRF1P14222 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRF1P14222 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRF1P14222 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRF1P14222 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRF1P14222 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PRF1P14222 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PRF1P14222 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRF1P14222 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRF1P14222 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRF1P14222 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRF1P14222 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRF1P14222 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRF1P14222 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRF1P14222 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRF1P14222 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRF1P14222 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRF1P14222 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRF1P14222 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRF1P14222 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRF1P14222 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRF1P14222 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRF1P14222 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRF1P14222 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRF1P14222 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRF1P14222 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRF1P14222 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRF1P14222 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRF1P14222 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRF1P14222 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRF1P14222 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRF1P14222 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRF1P14222 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRF1P14222 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRF1P14222 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRF1P14222 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRF1P14222 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRF1P14222 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRF1P14222 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRF1P14222 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRF1P14222 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRF1P14222 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRF1P14222 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRF1P14222 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRF1P14222 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRF1P14222 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRF1P14222 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRF1P14222 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRF1P14222 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRF1P14222 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRF1P14222 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRF1P14222 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRF1P14222 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRF1P14222 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRF1P14222 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRF1P14222 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRF1P14222 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRF1P14222 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRF1P14222 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRF1P14222 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRF1P14222 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRF1P14222 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms