Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RARBP10826 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
RARBP10826 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
RARBP10826 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RARBP10826 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RARBP10826 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RARBP10826 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RARBP10826 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RARBP10826 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RARBP10826 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RARBP10826 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RARBP10826 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RARBP10826 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RARBP10826 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RARBP10826 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RARBP10826 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RARBP10826 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RARBP10826 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
RARBP10826 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
RARBP10826 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RARBP10826 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RARBP10826 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
RARBP10826 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
RARBP10826 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RARBP10826 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RARBP10826 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RARBP10826 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RARBP10826 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RARBP10826 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RARBP10826 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RARBP10826 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RARBP10826 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RARBP10826 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RARBP10826 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
RARBP10826 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RARBP10826 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RARBP10826 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RARBP10826 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
RARBP10826 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RARBP10826 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RARBP10826 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RARBP10826 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
RARBP10826 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RARBP10826 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RARBP10826 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RARBP10826 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RARBP10826 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RARBP10826 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
RARBP10826 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RARBP10826 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
RARBP10826 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RARBP10826 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RARBP10826 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
RARBP10826 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
RARBP10826 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RARBP10826 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
RARBP10826 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
RARBP10826 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RARBP10826 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
RARBP10826 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
RARBP10826 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
RARBP10826 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RARBP10826 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RARBP10826 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RARBP10826 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RARBP10826 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RARBP10826 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RARBP10826 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RARBP10826 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RARBP10826 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RARBP10826 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RARBP10826 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RARBP10826 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RARBP10826 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RARBP10826 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RARBP10826 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
RARBP10826 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RARBP10826 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RARBP10826 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RARBP10826 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RARBP10826 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
RARBP10826 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RARBP10826 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RARBP10826 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RARBP10826 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RARBP10826 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RARBP10826 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RARBP10826 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RARBP10826 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RARBP10826 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RARBP10826 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RARBP10826 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
RARBP10826 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
RARBP10826 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RARBP10826 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
RARBP10826 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RARBP10826 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
RARBP10826 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RARBP10826 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RARBP10826 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms