Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GJB1P08034 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GJB1P08034 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GJB1P08034 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GJB1P08034 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GJB1P08034 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GJB1P08034 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GJB1P08034 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GJB1P08034 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
GJB1P08034 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GJB1P08034 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
GJB1P08034 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
GJB1P08034 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
GJB1P08034 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GJB1P08034 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
GJB1P08034 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
GJB1P08034 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
GJB1P08034 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
GJB1P08034 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GJB1P08034 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GJB1P08034 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GJB1P08034 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
GJB1P08034 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GJB1P08034 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
GJB1P08034 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GJB1P08034 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
GJB1P08034 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GJB1P08034 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GJB1P08034 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GJB1P08034 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
GJB1P08034 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
GJB1P08034 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GJB1P08034 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GJB1P08034 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GJB1P08034 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GJB1P08034 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GJB1P08034 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GJB1P08034 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GJB1P08034 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GJB1P08034 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GJB1P08034 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GJB1P08034 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GJB1P08034 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GJB1P08034 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GJB1P08034 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GJB1P08034 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GJB1P08034 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
GJB1P08034 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GJB1P08034 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GJB1P08034 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GJB1P08034 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
GJB1P08034 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GJB1P08034 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GJB1P08034 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GJB1P08034 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GJB1P08034 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJB1P08034 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
GJB1P08034 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJB1P08034 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
GJB1P08034 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJB1P08034 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GJB1P08034 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GJB1P08034 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GJB1P08034 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
GJB1P08034 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GJB1P08034 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GJB1P08034 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GJB1P08034 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJB1P08034 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GJB1P08034 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
GJB1P08034 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJB1P08034 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJB1P08034 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJB1P08034 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
GJB1P08034 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJB1P08034 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
GJB1P08034 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GJB1P08034 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GJB1P08034 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJB1P08034 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJB1P08034 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GJB1P08034 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GJB1P08034 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJB1P08034 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
GJB1P08034 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJB1P08034 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJB1P08034 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJB1P08034 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJB1P08034 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GJB1P08034 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GJB1P08034 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GJB1P08034 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GJB1P08034 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GJB1P08034 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GJB1P08034 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
GJB1P08034 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GJB1P08034 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GJB1P08034 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GJB1P08034 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GJB1P08034 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms