Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RETP07949 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RETP07949 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RETP07949 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RETP07949 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RETP07949 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RETP07949 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RETP07949 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RETP07949 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RETP07949 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RETP07949 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RETP07949 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RETP07949 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RETP07949 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RETP07949 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RETP07949 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RETP07949 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RETP07949 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RETP07949 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RETP07949 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RETP07949 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RETP07949 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RETP07949 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RETP07949 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RETP07949 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RETP07949 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RETP07949 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RETP07949 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RETP07949 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RETP07949 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RETP07949 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RETP07949 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RETP07949 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RETP07949 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RETP07949 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
RETP07949 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
RETP07949 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RETP07949 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RETP07949 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RETP07949 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RETP07949 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RETP07949 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RETP07949 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RETP07949 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RETP07949 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RETP07949 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RETP07949 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RETP07949 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RETP07949 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RETP07949 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RETP07949 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RETP07949 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RETP07949 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RETP07949 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RETP07949 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RETP07949 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RETP07949 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RETP07949 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RETP07949 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RETP07949 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RETP07949 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RETP07949 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RETP07949 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RETP07949 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RETP07949 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RETP07949 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RETP07949 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RETP07949 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RETP07949 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RETP07949 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RETP07949 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RETP07949 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RETP07949 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RETP07949 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RETP07949 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RETP07949 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RETP07949 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RETP07949 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RETP07949 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RETP07949 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RETP07949 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RETP07949 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RETP07949 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RETP07949 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RETP07949 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RETP07949 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RETP07949 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RETP07949 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RETP07949 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RETP07949 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RETP07949 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RETP07949 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RETP07949 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RETP07949 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RETP07949 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RETP07949 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RETP07949 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RETP07949 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RETP07949 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RETP07949 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms