Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SVILO95425 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SVILO95425 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SVILO95425 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SVILO95425 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SVILO95425 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SVILO95425 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SVILO95425 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SVILO95425 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SVILO95425 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SVILO95425 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SVILO95425 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SVILO95425 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SVILO95425 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SVILO95425 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SVILO95425 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SVILO95425 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SVILO95425 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SVILO95425 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SVILO95425 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SVILO95425 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SVILO95425 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SVILO95425 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SVILO95425 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SVILO95425 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SVILO95425 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SVILO95425 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SVILO95425 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SVILO95425 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SVILO95425 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SVILO95425 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SVILO95425 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SVILO95425 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SVILO95425 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SVILO95425 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SVILO95425 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SVILO95425 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SVILO95425 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SVILO95425 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SVILO95425 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SVILO95425 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SVILO95425 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SVILO95425 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SVILO95425 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SVILO95425 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SVILO95425 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SVILO95425 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SVILO95425 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SVILO95425 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SVILO95425 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SVILO95425 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SVILO95425 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SVILO95425 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SVILO95425 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SVILO95425 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SVILO95425 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SVILO95425 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SVILO95425 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SVILO95425 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SVILO95425 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SVILO95425 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SVILO95425 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SVILO95425 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SVILO95425 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SVILO95425 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SVILO95425 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SVILO95425 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SVILO95425 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SVILO95425 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SVILO95425 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SVILO95425 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SVILO95425 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SVILO95425 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SVILO95425 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SVILO95425 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SVILO95425 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SVILO95425 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SVILO95425 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SVILO95425 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SVILO95425 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SVILO95425 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SVILO95425 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SVILO95425 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SVILO95425 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SVILO95425 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SVILO95425 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SVILO95425 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SVILO95425 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SVILO95425 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SVILO95425 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SVILO95425 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SVILO95425 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SVILO95425 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SVILO95425 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SVILO95425 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SVILO95425 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SVILO95425 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SVILO95425 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SVILO95425 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SVILO95425 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1095.2 ms