Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KIF4AO95239 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
KIF4AO95239 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
KIF4AO95239 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIF4AO95239 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
KIF4AO95239 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIF4AO95239 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIF4AO95239 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KIF4AO95239 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
KIF4AO95239 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
KIF4AO95239 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KIF4AO95239 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
KIF4AO95239 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIF4AO95239 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
KIF4AO95239 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KIF4AO95239 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
KIF4AO95239 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
KIF4AO95239 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KIF4AO95239 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KIF4AO95239 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIF4AO95239 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KIF4AO95239 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KIF4AO95239 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KIF4AO95239 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KIF4AO95239 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KIF4AO95239 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
KIF4AO95239 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KIF4AO95239 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIF4AO95239 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIF4AO95239 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIF4AO95239 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
KIF4AO95239 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIF4AO95239 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIF4AO95239 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KIF4AO95239 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
KIF4AO95239 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIF4AO95239 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KIF4AO95239 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KIF4AO95239 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KIF4AO95239 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
KIF4AO95239 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIF4AO95239 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
KIF4AO95239 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIF4AO95239 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
KIF4AO95239 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIF4AO95239 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIF4AO95239 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KIF4AO95239 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIF4AO95239 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIF4AO95239 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KIF4AO95239 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KIF4AO95239 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
KIF4AO95239 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIF4AO95239 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIF4AO95239 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIF4AO95239 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
KIF4AO95239 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
KIF4AO95239 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
KIF4AO95239 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIF4AO95239 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIF4AO95239 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
KIF4AO95239 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
KIF4AO95239 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
KIF4AO95239 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KIF4AO95239 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KIF4AO95239 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIF4AO95239 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
KIF4AO95239 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
KIF4AO95239 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
KIF4AO95239 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
KIF4AO95239 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KIF4AO95239 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
KIF4AO95239 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
KIF4AO95239 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
KIF4AO95239 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIF4AO95239 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIF4AO95239 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
KIF4AO95239 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KIF4AO95239 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
KIF4AO95239 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KIF4AO95239 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
KIF4AO95239 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KIF4AO95239 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KIF4AO95239 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KIF4AO95239 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIF4AO95239 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KIF4AO95239 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIF4AO95239 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KIF4AO95239 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIF4AO95239 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KIF4AO95239 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIF4AO95239 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KIF4AO95239 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KIF4AO95239 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIF4AO95239 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIF4AO95239 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KIF4AO95239 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIF4AO95239 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KIF4AO95239 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KIF4AO95239 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms