Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEBLO76041 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEBLO76041 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEBLO76041 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NEBLO76041 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEBLO76041 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEBLO76041 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEBLO76041 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEBLO76041 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEBLO76041 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEBLO76041 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEBLO76041 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NEBLO76041 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEBLO76041 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NEBLO76041 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NEBLO76041 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NEBLO76041 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NEBLO76041 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEBLO76041 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NEBLO76041 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NEBLO76041 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NEBLO76041 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NEBLO76041 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NEBLO76041 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NEBLO76041 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEBLO76041 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NEBLO76041 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NEBLO76041 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEBLO76041 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NEBLO76041 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEBLO76041 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NEBLO76041 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEBLO76041 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEBLO76041 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEBLO76041 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEBLO76041 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEBLO76041 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEBLO76041 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEBLO76041 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEBLO76041 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEBLO76041 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEBLO76041 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEBLO76041 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEBLO76041 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEBLO76041 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEBLO76041 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEBLO76041 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEBLO76041 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEBLO76041 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEBLO76041 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEBLO76041 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEBLO76041 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEBLO76041 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEBLO76041 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEBLO76041 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEBLO76041 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEBLO76041 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEBLO76041 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEBLO76041 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEBLO76041 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEBLO76041 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEBLO76041 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEBLO76041 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEBLO76041 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEBLO76041 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEBLO76041 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEBLO76041 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEBLO76041 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEBLO76041 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEBLO76041 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEBLO76041 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEBLO76041 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEBLO76041 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEBLO76041 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEBLO76041 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEBLO76041 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEBLO76041 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEBLO76041 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEBLO76041 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEBLO76041 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NEBLO76041 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEBLO76041 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NEBLO76041 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEBLO76041 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEBLO76041 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NEBLO76041 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEBLO76041 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NEBLO76041 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NEBLO76041 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NEBLO76041 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NEBLO76041 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NEBLO76041 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NEBLO76041 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEBLO76041 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NEBLO76041 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NEBLO76041 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEBLO76041 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NEBLO76041 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEBLO76041 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NEBLO76041 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms