Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSO75390 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSO75390 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSO75390 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSO75390 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CSO75390 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSO75390 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CSO75390 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSO75390 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSO75390 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSO75390 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSO75390 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSO75390 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSO75390 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSO75390 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSO75390 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSO75390 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSO75390 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSO75390 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSO75390 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CSO75390 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSO75390 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CSO75390 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSO75390 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSO75390 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSO75390 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSO75390 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSO75390 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSO75390 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CSO75390 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSO75390 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CSO75390 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CSO75390 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CSO75390 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CSO75390 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CSO75390 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CSO75390 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSO75390 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSO75390 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSO75390 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSO75390 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSO75390 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSO75390 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSO75390 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CSO75390 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSO75390 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CSO75390 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSO75390 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSO75390 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSO75390 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSO75390 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CSO75390 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSO75390 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSO75390 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CSO75390 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CSO75390 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSO75390 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CSO75390 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CSO75390 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CSO75390 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CSO75390 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CSO75390 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CSO75390 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CSO75390 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSO75390 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CSO75390 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CSO75390 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSO75390 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSO75390 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CSO75390 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CSO75390 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSO75390 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CSO75390 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CSO75390 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSO75390 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSO75390 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSO75390 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSO75390 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSO75390 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSO75390 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CSO75390 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSO75390 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSO75390 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSO75390 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSO75390 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSO75390 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSO75390 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSO75390 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CSO75390 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CSO75390 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSO75390 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSO75390 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSO75390 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSO75390 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSO75390 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSO75390 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSO75390 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSO75390 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CSO75390 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSO75390 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms