Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC61.19■■■■■ 7.39
ABCC9O60706 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC61.16■■■■■ 7.38
ABCC9O60706 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.11■■■■■ 7.37
ABCC9O60706 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC61.06■■■■■ 7.36
ABCC9O60706 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC60.94■■■■■ 7.35
ABCC9O60706 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC60.9■■■■■ 7.34
ABCC9O60706 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC60.88■■■■■ 7.34
ABCC9O60706 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.88■■■■■ 7.34
ABCC9O60706 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC60.86■■■■■ 7.33
ABCC9O60706 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.73■■■■■ 7.31
ABCC9O60706 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.63■■■■■ 7.3
ABCC9O60706 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC60.61■■■■■ 7.29
ABCC9O60706 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.55■■■■■ 7.28
ABCC9O60706 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC60.52■■■■■ 7.28
ABCC9O60706 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC60.51■■■■■ 7.28
ABCC9O60706 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC60.43■■■■■ 7.26
ABCC9O60706 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.42■■■■■ 7.26
ABCC9O60706 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC60.39■■■■■ 7.26
ABCC9O60706 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC60.36■■■■■ 7.25
ABCC9O60706 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC60.33■■■■■ 7.25
ABCC9O60706 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.31■■■■■ 7.25
ABCC9O60706 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.31■■■■■ 7.24
ABCC9O60706 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.31■■■■■ 7.24
ABCC9O60706 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC60.19■■■■■ 7.23
ABCC9O60706 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC60.18■■■■■ 7.22
ABCC9O60706 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC60.05■■■■■ 7.2
ABCC9O60706 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC60.01■■■■■ 7.2
ABCC9O60706 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC60■■■■■ 7.2
ABCC9O60706 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC59.99■■■■■ 7.19
ABCC9O60706 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC59.93■■■■■ 7.18
ABCC9O60706 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC59.92■■■■■ 7.18
ABCC9O60706 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC59.91■■■■■ 7.18
ABCC9O60706 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.9■■■■■ 7.18
ABCC9O60706 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC59.89■■■■■ 7.18
ABCC9O60706 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC59.88■■■■■ 7.18
ABCC9O60706 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.84■■■■■ 7.17
ABCC9O60706 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC59.82■■■■■ 7.17
ABCC9O60706 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC59.8■■■■■ 7.16
ABCC9O60706 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC59.75■■■■■ 7.16
ABCC9O60706 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC59.74■■■■■ 7.15
ABCC9O60706 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC59.72■■■■■ 7.15
ABCC9O60706 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC59.72■■■■■ 7.15
ABCC9O60706 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC59.7■■■■■ 7.15
ABCC9O60706 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.62■■■■■ 7.13
ABCC9O60706 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC59.62■■■■■ 7.13
ABCC9O60706 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC59.62■■■■■ 7.13
ABCC9O60706 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.6■■■■■ 7.13
ABCC9O60706 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.59■■■■■ 7.13
ABCC9O60706 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.57■■■■■ 7.13
ABCC9O60706 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC59.56■■■■■ 7.13
ABCC9O60706 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.55■■■■■ 7.12
ABCC9O60706 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC59.49■■■■■ 7.11
ABCC9O60706 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC59.49■■■■■ 7.11
ABCC9O60706 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.47■■■■■ 7.11
ABCC9O60706 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC59.32■■■■■ 7.09
ABCC9O60706 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.32■■■■■ 7.09
ABCC9O60706 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC59.31■■■■■ 7.09
ABCC9O60706 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC59.29■■■■■ 7.08
ABCC9O60706 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC59.25■■■■■ 7.08
ABCC9O60706 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC59.24■■■■■ 7.07
ABCC9O60706 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC59.22■■■■■ 7.07
ABCC9O60706 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC59.22■■■■■ 7.07
ABCC9O60706 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC59.17■■■■■ 7.06
ABCC9O60706 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC59.15■■■■■ 7.06
ABCC9O60706 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59.11■■■■■ 7.05
ABCC9O60706 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC59.1■■■■■ 7.05
ABCC9O60706 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC59.07■■■■■ 7.05
ABCC9O60706 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC59.07■■■■■ 7.05
ABCC9O60706 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC59.06■■■■■ 7.05
ABCC9O60706 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC59.02■■■■■ 7.04
ABCC9O60706 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC59.02■■■■■ 7.04
ABCC9O60706 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC59.02■■■■■ 7.04
ABCC9O60706 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC59■■■■■ 7.04
ABCC9O60706 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC58.95■■■■■ 7.03
ABCC9O60706 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.93■■■■■ 7.02
ABCC9O60706 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC58.92■■■■■ 7.02
ABCC9O60706 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.91■■■■■ 7.02
ABCC9O60706 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC58.88■■■■■ 7.02
ABCC9O60706 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC58.84■■■■■ 7.01
ABCC9O60706 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.84■■■■■ 7.01
ABCC9O60706 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.83■■■■■ 7.01
ABCC9O60706 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.83■■■■■ 7.01
ABCC9O60706 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC58.78■■■■■ 7
ABCC9O60706 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC58.77■■■■■ 7
ABCC9O60706 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC58.75■■■■■ 7
ABCC9O60706 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.75■■■■■ 7
ABCC9O60706 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC58.75■■■■■ 7
ABCC9O60706 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.74■■■■■ 6.99
ABCC9O60706 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC58.74■■■■■ 6.99
ABCC9O60706 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC58.72■■■■■ 6.99
ABCC9O60706 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC58.66■■■■■ 6.98
ABCC9O60706 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC58.58■■■■■ 6.97
ABCC9O60706 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC58.58■■■■■ 6.97
ABCC9O60706 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC58.5■■■■■ 6.96
ABCC9O60706 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC58.47■■■■■ 6.95
ABCC9O60706 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.47■■■■■ 6.95
ABCC9O60706 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC58.45■■■■■ 6.95
ABCC9O60706 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC58.43■■■■■ 6.94
ABCC9O60706 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC58.42■■■■■ 6.94
ABCC9O60706 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC58.42■■■■■ 6.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms