Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MAP3K13O43283 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MAP3K13O43283 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MAP3K13O43283 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K13O43283 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MAP3K13O43283 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MAP3K13O43283 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
MAP3K13O43283 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K13O43283 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
MAP3K13O43283 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
MAP3K13O43283 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
MAP3K13O43283 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MAP3K13O43283 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MAP3K13O43283 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K13O43283 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K13O43283 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MAP3K13O43283 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MAP3K13O43283 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MAP3K13O43283 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K13O43283 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MAP3K13O43283 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K13O43283 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K13O43283 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K13O43283 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MAP3K13O43283 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K13O43283 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K13O43283 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MAP3K13O43283 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K13O43283 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MAP3K13O43283 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MAP3K13O43283 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K13O43283 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MAP3K13O43283 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MAP3K13O43283 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K13O43283 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MAP3K13O43283 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K13O43283 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MAP3K13O43283 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MAP3K13O43283 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MAP3K13O43283 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K13O43283 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MAP3K13O43283 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MAP3K13O43283 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K13O43283 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MAP3K13O43283 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAP3K13O43283 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAP3K13O43283 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MAP3K13O43283 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MAP3K13O43283 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MAP3K13O43283 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
MAP3K13O43283 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K13O43283 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K13O43283 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MAP3K13O43283 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MAP3K13O43283 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MAP3K13O43283 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MAP3K13O43283 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K13O43283 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MAP3K13O43283 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
MAP3K13O43283 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MAP3K13O43283 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MAP3K13O43283 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAP3K13O43283 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAP3K13O43283 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MAP3K13O43283 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAP3K13O43283 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
MAP3K13O43283 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MAP3K13O43283 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K13O43283 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MAP3K13O43283 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K13O43283 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MAP3K13O43283 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K13O43283 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MAP3K13O43283 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MAP3K13O43283 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MAP3K13O43283 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MAP3K13O43283 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K13O43283 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MAP3K13O43283 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K13O43283 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K13O43283 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MAP3K13O43283 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K13O43283 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MAP3K13O43283 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MAP3K13O43283 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K13O43283 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K13O43283 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MAP3K13O43283 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MAP3K13O43283 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MAP3K13O43283 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms