Protein–RNA interactions for Protein: O15265

ATXN7, Ataxin-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7O15265 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN7O15265 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATXN7O15265 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN7O15265 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN7O15265 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN7O15265 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATXN7O15265 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN7O15265 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN7O15265 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATXN7O15265 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN7O15265 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN7O15265 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN7O15265 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATXN7O15265 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN7O15265 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN7O15265 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATXN7O15265 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN7O15265 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN7O15265 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN7O15265 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATXN7O15265 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATXN7O15265 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN7O15265 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN7O15265 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN7O15265 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATXN7O15265 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN7O15265 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN7O15265 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN7O15265 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN7O15265 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN7O15265 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATXN7O15265 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN7O15265 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN7O15265 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN7O15265 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN7O15265 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ATXN7O15265 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN7O15265 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATXN7O15265 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN7O15265 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATXN7O15265 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATXN7O15265 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN7O15265 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN7O15265 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATXN7O15265 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN7O15265 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATXN7O15265 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATXN7O15265 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN7O15265 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATXN7O15265 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATXN7O15265 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN7O15265 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ATXN7O15265 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATXN7O15265 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATXN7O15265 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATXN7O15265 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATXN7O15265 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN7O15265 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN7O15265 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATXN7O15265 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATXN7O15265 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATXN7O15265 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN7O15265 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN7O15265 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN7O15265 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN7O15265 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN7O15265 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN7O15265 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN7O15265 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN7O15265 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN7O15265 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN7O15265 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN7O15265 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN7O15265 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATXN7O15265 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN7O15265 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN7O15265 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN7O15265 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN7O15265 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN7O15265 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN7O15265 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN7O15265 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN7O15265 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN7O15265 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN7O15265 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATXN7O15265 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATXN7O15265 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATXN7O15265 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATXN7O15265 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms