Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLR1CO15160 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1CO15160 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLR1CO15160 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLR1CO15160 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR1CO15160 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1CO15160 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR1CO15160 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR1CO15160 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR1CO15160 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1CO15160 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR1CO15160 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR1CO15160 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR1CO15160 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR1CO15160 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR1CO15160 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR1CO15160 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
POLR1CO15160 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLR1CO15160 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1CO15160 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLR1CO15160 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1CO15160 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLR1CO15160 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLR1CO15160 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1CO15160 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1CO15160 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1CO15160 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1CO15160 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1CO15160 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1CO15160 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1CO15160 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1CO15160 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1CO15160 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1CO15160 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1CO15160 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1CO15160 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1CO15160 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR1CO15160 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1CO15160 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1CO15160 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1CO15160 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1CO15160 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1CO15160 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1CO15160 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1CO15160 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1CO15160 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1CO15160 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
POLR1CO15160 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLR1CO15160 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1CO15160 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1CO15160 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1CO15160 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1CO15160 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1CO15160 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1CO15160 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1CO15160 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1CO15160 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1CO15160 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1CO15160 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1CO15160 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1CO15160 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1CO15160 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1CO15160 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1CO15160 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1CO15160 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1CO15160 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1CO15160 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1CO15160 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1CO15160 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1CO15160 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1CO15160 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1CO15160 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR1CO15160 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1CO15160 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1CO15160 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR1CO15160 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1CO15160 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1CO15160 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1CO15160 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms