Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
PTPRTO14522 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
PTPRTO14522 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
PTPRTO14522 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
PTPRTO14522 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
PTPRTO14522 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
PTPRTO14522 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
PTPRTO14522 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PTPRTO14522 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PTPRTO14522 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
PTPRTO14522 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
PTPRTO14522 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
PTPRTO14522 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
PTPRTO14522 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
PTPRTO14522 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
PTPRTO14522 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
PTPRTO14522 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
PTPRTO14522 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PTPRTO14522 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
PTPRTO14522 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PTPRTO14522 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PTPRTO14522 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
PTPRTO14522 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
PTPRTO14522 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
PTPRTO14522 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
PTPRTO14522 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PTPRTO14522 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
PTPRTO14522 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.03■■■■■ 4.48
PTPRTO14522 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PTPRTO14522 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
PTPRTO14522 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
PTPRTO14522 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
PTPRTO14522 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
PTPRTO14522 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
PTPRTO14522 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PTPRTO14522 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
PTPRTO14522 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
PTPRTO14522 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PTPRTO14522 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PTPRTO14522 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PTPRTO14522 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PTPRTO14522 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
PTPRTO14522 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PTPRTO14522 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PTPRTO14522 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
PTPRTO14522 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PTPRTO14522 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PTPRTO14522 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PTPRTO14522 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PTPRTO14522 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PTPRTO14522 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
PTPRTO14522 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
PTPRTO14522 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PTPRTO14522 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PTPRTO14522 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PTPRTO14522 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PTPRTO14522 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PTPRTO14522 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
PTPRTO14522 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PTPRTO14522 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
PTPRTO14522 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
PTPRTO14522 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PTPRTO14522 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
PTPRTO14522 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PTPRTO14522 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PTPRTO14522 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
PTPRTO14522 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
PTPRTO14522 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
PTPRTO14522 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PTPRTO14522 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.94■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
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