Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
PTPRTO14522 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
PTPRTO14522 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
PTPRTO14522 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
PTPRTO14522 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
PTPRTO14522 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
PTPRTO14522 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
PTPRTO14522 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PTPRTO14522 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
PTPRTO14522 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
PTPRTO14522 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
PTPRTO14522 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
PTPRTO14522 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.53■■■■■ 4.56
PTPRTO14522 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
PTPRTO14522 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
PTPRTO14522 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
PTPRTO14522 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
PTPRTO14522 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
PTPRTO14522 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
PTPRTO14522 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
PTPRTO14522 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
PTPRTO14522 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
PTPRTO14522 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
PTPRTO14522 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
PTPRTO14522 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
PTPRTO14522 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
PTPRTO14522 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
PTPRTO14522 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.03■■■■■ 4.48
PTPRTO14522 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
PTPRTO14522 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
PTPRTO14522 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
PTPRTO14522 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.89■■■■■ 4.46
PTPRTO14522 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
PTPRTO14522 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
PTPRTO14522 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
PTPRTO14522 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
PTPRTO14522 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
PTPRTO14522 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PTPRTO14522 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PTPRTO14522 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PTPRTO14522 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PTPRTO14522 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
PTPRTO14522 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PTPRTO14522 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
PTPRTO14522 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
PTPRTO14522 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PTPRTO14522 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PTPRTO14522 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
PTPRTO14522 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PTPRTO14522 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PTPRTO14522 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.54■■■■■ 4.4
PTPRTO14522 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
PTPRTO14522 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
PTPRTO14522 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
PTPRTO14522 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
PTPRTO14522 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PTPRTO14522 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
PTPRTO14522 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.27■■■■■ 4.36
PTPRTO14522 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
PTPRTO14522 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
PTPRTO14522 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
PTPRTO14522 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
PTPRTO14522 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.11■■■■■ 4.33
PTPRTO14522 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
PTPRTO14522 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
PTPRTO14522 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
PTPRTO14522 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
PTPRTO14522 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
PTPRTO14522 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
PTPRTO14522 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
PTPRTO14522 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
PTPRTO14522 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
PTPRTO14522 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.94■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
PTPRTO14522 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms