Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
POTEFA5A3E0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
POTEFA5A3E0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
POTEFA5A3E0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
POTEFA5A3E0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
POTEFA5A3E0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
POTEFA5A3E0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
POTEFA5A3E0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
POTEFA5A3E0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
POTEFA5A3E0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
POTEFA5A3E0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
POTEFA5A3E0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
POTEFA5A3E0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
POTEFA5A3E0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
POTEFA5A3E0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
POTEFA5A3E0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POTEFA5A3E0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
POTEFA5A3E0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
POTEFA5A3E0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
POTEFA5A3E0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
POTEFA5A3E0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
POTEFA5A3E0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
POTEFA5A3E0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
POTEFA5A3E0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
POTEFA5A3E0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
POTEFA5A3E0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
POTEFA5A3E0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
POTEFA5A3E0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
POTEFA5A3E0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
POTEFA5A3E0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
POTEFA5A3E0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
POTEFA5A3E0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
POTEFA5A3E0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
POTEFA5A3E0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
POTEFA5A3E0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POTEFA5A3E0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
POTEFA5A3E0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
POTEFA5A3E0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
POTEFA5A3E0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
POTEFA5A3E0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
POTEFA5A3E0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
POTEFA5A3E0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
POTEFA5A3E0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
POTEFA5A3E0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
POTEFA5A3E0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
POTEFA5A3E0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
POTEFA5A3E0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
POTEFA5A3E0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
POTEFA5A3E0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
POTEFA5A3E0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
POTEFA5A3E0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
POTEFA5A3E0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
POTEFA5A3E0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
POTEFA5A3E0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
POTEFA5A3E0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
POTEFA5A3E0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
POTEFA5A3E0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
POTEFA5A3E0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
POTEFA5A3E0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
POTEFA5A3E0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
POTEFA5A3E0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
POTEFA5A3E0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
POTEFA5A3E0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
POTEFA5A3E0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POTEFA5A3E0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
POTEFA5A3E0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
POTEFA5A3E0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
POTEFA5A3E0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
POTEFA5A3E0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
POTEFA5A3E0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
POTEFA5A3E0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
POTEFA5A3E0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
POTEFA5A3E0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
POTEFA5A3E0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
POTEFA5A3E0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
POTEFA5A3E0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
POTEFA5A3E0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POTEFA5A3E0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
POTEFA5A3E0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
POTEFA5A3E0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
POTEFA5A3E0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
POTEFA5A3E0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
POTEFA5A3E0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
POTEFA5A3E0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
POTEFA5A3E0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
POTEFA5A3E0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
POTEFA5A3E0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
POTEFA5A3E0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
POTEFA5A3E0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
POTEFA5A3E0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
POTEFA5A3E0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
POTEFA5A3E0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POTEFA5A3E0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POTEFA5A3E0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POTEFA5A3E0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POTEFA5A3E0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
POTEFA5A3E0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
POTEFA5A3E0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POTEFA5A3E0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POTEFA5A3E0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms