Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A0

COQ4, Ubiquinone biosynthesis protein COQ4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ4Q9Y3A0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COQ4Q9Y3A0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COQ4Q9Y3A0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COQ4Q9Y3A0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COQ4Q9Y3A0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms