Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEU3Q9UQ49 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEU3Q9UQ49 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEU3Q9UQ49 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms