Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C4Q9UKN8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C4Q9UKN8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms