Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCTPQ9UKL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCTPQ9UKL6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCTPQ9UKL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms