Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV5

RAPGEFL1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEFL1Q9UHV5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAPGEFL1Q9UHV5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAPGEFL1Q9UHV5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAPGEFL1Q9UHV5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.4 ms