Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC41.34■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC41.33■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
PDS5BQ9NTI5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PDS5BQ9NTI5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
PDS5BQ9NTI5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
PDS5BQ9NTI5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PDS5BQ9NTI5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PDS5BQ9NTI5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.1 ms