Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPHNQ9NQX3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPHNQ9NQX3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms