Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZCCHC17Q9NP64 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZCCHC17Q9NP64 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZCCHC17Q9NP64 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZCCHC17Q9NP64 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms