Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
BPIFA1Q9NP55 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BPIFA1Q9NP55 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BPIFA1Q9NP55 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms