Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIPAS39Q9H9C1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VIPAS39Q9H9C1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VIPAS39Q9H9C1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms