Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LSM14BQ9BX40 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LSM14BQ9BX40 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LSM14BQ9BX40 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2557.7 ms